Sem duvidas o Linux é mais eficiente, na verdade o Linux é muito mais eficiente que o Windows em diversos fatores, só perdendo no gerenciamento de consumo de bateria de portáteis (notebooks e netbooks). Como ate ja foi comentado pelo Issak o sistema de paginação do Windows é precário e arcaico. O Swap é bem mais moderno neste quesito que o windows, o que da uma garantia de desempenho bem melhor.