Existes um vírus que causa esse problema chamado "beagle", provavelmente pelas informações passadas possa ser isso.
Entre no modo de segurança (ao iniciar o micro pressione F8 várias vezes e escolha a opção MODO DE SEGURANÇA)
entre no MSCONFIG e desabilite alguns itens estranhos (em geral são os da pasta windows/system32), e reinicie o micro normalmente e tente entrar no MSCONFIG
em caso de afirmativo,feche ele sem salvar,atualize seu programa de antivírus pela internet e faça a varredura após atualiza,pois ainda está com vírus.
Caso você não possua um antivírus confiável em sua máquina,vá até o site da SYMANTEC,no item do site FERRAMENTAS DE REMOÇÃO,e baixe a ferramenta que remove o vírus
"beagle",acredito que dessa forma você estará livre dele.
Já tive um problema igual ao seu no computador de um colega e resolvi com esse procedimento.
Qualquer coisa poste.