Sempre que quiser desinstalar um programa, desinstale-o pelo painel de controle, item remover programa. Provavelmente vc deve ter apagado algumas pastas de forma manual e com isso pode ter apagado arquivos de sistema do windows. Também vc poderia usar o programa Ccleaner, por onde também poderia apagar os programas e remover os programas que são inicializados junto com o windows, além de fazer a limpeza dos arquivos em todo o Pc.
Agora, logo ao dar o boot, aperte a tecla F8 e dependendo do seu windows, veja se entra em Modo de segurança ou última configuração válida ou ainda em Reparar meu computador e veja se tem a opção de fazer uma restauração de sistema, então restaure para uma data anterior ao problema.