Vamos por partes:
CMOS (a pronuncia correta é: "Cí-Mós" é uma sigla para complementary metal-oxide-semiconductor - É a Tecnologia em si, empregada na fabricação de Ci´s = Circuito Integrado, também conhecido como microchips
BIOS = Que significa Basic Input/Output System (Sistema Básico de Entrada/Saída) é o programa (firmware) que fica gravado de forma permanente em um Chip conhecido como Flash ROM que é um tipo de Ci (circuito integrado) fabricado com a tecnologia CMOS. Ele é responsável pelo suporte básico de acesso a todo o hardware, bem como por iniciar o sistema operacional
SETUP = É o local onde acessamos o programa (software) BIOS que está gravado em um Flash ROM que é um Ci fabricado com a tecnologia CMOS e configuramos conforme a necessidade. Ele é acessado quando na inicialização do sistemas, geralmente pressionando a tecla <del> ou <F12> ou <F10> conforme o equipamento.
Flash ROM ou Memória flash é uma memória de computador do tipo
EEPROM (Electrically-Erasable Programmable Read-Only Memory), Este tipo de memória pode ter o seu conteúdo alterado, mas é diferente de uma Memória RAM, por exemplo.
Pesquise mais sobre isso, tem muita informação na internet.
Abraços e Boa Sorte