Numa janela qualquer, clique sobre toda a unidade com o botão direito, vá em propriedades, então veja quanto aparece de espaço usado e espaço livre e espaço total. Se aparecer bastante espaço usado, os arquivos estarão apenas ocultos pela ação de malwares, e vc poderá usar dicas para desoculta-los.
Já se aparecer que todo o espaço está livre, então poderá tentar programas para recuperação de arquivos apagados.