Os arquivos do Hd externo podem ter sido ocultados por ação de vírus, mas continuam no Hd, para ver arquivos ocultos no Mac, faça isso: http://goo.gl/kj11Ik
Se vc tiver acesso a um sistema Windows, pode tentar instalar esse programa: http://goo.gl/tv7Jcy que permite acesso de leitura somente ao sistema Hfs+ utilizado nos discos Mac, e tente acessar os arquivos do Windows, onde poderá copiar para outro local, e usar essa dica para desocultá-los no Windows: http://goo.gl/RH3mhi