Além da interface e da possibilidade de eliminar o horrível cabo flat do seu gabinete, não há nenhuma diferença. A qualidade e velocidade são as mesmas, mesmo com o avanço da tecnologia SATA.
Um gravador não consegue usar todo o potencial de uma interface IDE, muito menos um SATA - é como se você pudesse andar numa Autobahn alemã a 250 km/h e só tivesse um Fiat Uno.