Boa noite Almeida.
Existe uma ampla discussão sobre o tema, mas pelo menos um consenso: a desfragmentação do disco rígido melhora seu desempenho (e a do sistema como um todo) e reduz significativamente a incidência de problemas com a unidade de armazenamento. Entretanto, encontrar um tempinho em meio a tantas atividades no decorrer do dia, torna a execução desta ação pelos usuários uma verdadeira raridade.
Para contornar essa falta de tempo, é possível comandar o Windows para que realize esse trabalho em datas marcadas e isso pode ser feito rapidamente.
Para fazer com que esse procedimento se torne automático (no Windows XP), clique em Iniciar, Todos os Programas, Acessórios, Ferramentas do Sistema, Tarefas Agendadas. Dê um duplo clique em Adicionar Tarefa Agendada para iniciar o programa e clique em Avançar.Já no Windows 7, voce click no menu iniciar,todos os programas, pasta acessórios, ferramentas do sistema, desfragmentador de disco e configure o agendamento ou desfragmente manualmente!Sugiro um ótimo software para defragmentação Perfect Disk 11 é pago mas vale a pena!
Segue o link do software:
http://www.raxco.com/
Na lista de aplicativos, selecione Prompt de Comando e clique Avançar. Se você não conseguir visualizar o Prompt de Comando na lista, clique em Procurar, encontre e selecione o arquivo ‘cmd.exe’ na pasta System32 do Windows e clique em Abrir.
Escolha um intervalo de tempo (mensal é uma boa opção) e clique Avançar. Especifique o horário, dia e mês, e clique Avançar novamente. Entre com o nome de usuário e senha que você usa para fazer login, e clique Avançar. Selecione Abrir Propriedades Avançadas para esta Tarefa Quando clicar Finalizar, e então clique Finalizar.
Com a aba Tarefas selecionada, edite o texto na janela Executar, para que ele fique assim: c:\windows\system32\cmd.exe /c defrag c: -f -v > "c:\doc\report.txt" (seus caminhos e opções podem ser diferentes). Clique OK, e entre seu nome de usuário e senha novamente. Finalmente, clique OK mais uma vez. Você talvez tenha que confirmar seu login e senha novamente.
Fonte com algumas modificações.
PC WORLD
Espero ter ajudado.